Komisije Vijeća Hrvatskog olimpijskog odbora savjetodavna su radna tijela zadužena za izvršavanje određenih zadaća. Pri HOO-u djeluju Komisija za razvoj sporta, Komisija za međunarodne odnose, Komisija za informiranje i izdavaštvo, Zdravstvena komisija, Komisija za ravnopravnost spolova u sportu, Komisija za marketing, Komisija za sportsko graditeljstvo i okoliš, Komisija za digitalizaciju i nove medije te Komisija za dual karijeru u sportu (osnovana 5. prosinca 2019. godine odlukom Vijeća HOO-a). Mandat članova komisije traje istodobno s mandatom Vijeća odnosno Skupštine HOO-a. Rad pojedine komisije uređen je Statutom HOO-a i pravilnikom.
Sastav komisija Vijeća HOO-a u mandatu od 2020. do 2024. godine